商品流通企业需缴纳的税费主要包括以下几类：增值税、城建税、企业所得税、房产税、城镇土地使用税、车船税、印花税、教育费附加以及个人所得税。此外，当有偿转让国有土地使用权及地上建筑物及其附着物时，还需缴纳土地增值税。具体应缴纳的税费种类需根据实际情况确定。