在处理已转账但未收到发票的业务时，必须依据转账时的具体情况进行确认。如果公司仅将款项记入预付账款科目，那么在实际接收到货物和发票后，应相应减少预付账款的数额。反之，若企业已根据送货单或合同金额对货物进行了记账，则在获得正式发票时，首先需调整之前估算的金额，接着按照实际发票所示金额重新入账。