在增值税综合服务平台上，首先需要根据收到的纸质发票进行勾选。完成勾选后，提交申请以进行统计处理。统计完成后，确认签名并前往电子税务局填写附表二。填好附表二后，系统会自动将进项税额数据带入主表中的相应栏次，从而可以进行销项税的抵扣操作。
进项税是指企业在采购物品时所支付的增值税额，这部分金额会被记录在采购总价中。而销项税则是企业在销售商品时从客户那里收到的销售总价中的增值税款。每个月，企业需要将所有的销项税额减去进项税来计算应纳税额。如果结果是正数，则意味着企业需要向税务局缴纳税款；反之，如果是零或者负数，则无需缴税。