跨年发票冲红操作流程如下：首先，在开票系统中填写红字发票信息表，随后提交至税务机关进行审批。一旦获得批准，根据通知单号码录入系统以开具负数发票。

关于销项负数发票的账务处理，具体步骤如下：

借方科目为主营业务收入，应交税费—应交增值税（销项税额）；贷方科目则包括应收账款等相关项目。

此外，还需进行库存商品的调整，即借记库存商品，贷记主营业务成本。这样能够确保财务记录的准确性和完整性。